No,sono due cose completamente diverse: il dot by dot mappa,come dice il nome,la matrice 1:1,eliminando l'overscan,ma insieme a quello potresti attivare tutti i filtri che la tv mette a disposizione,ad esempio.
Il pure mode,e qui rispondo anche a Nero,elimina le elaborazioni,intese non solo come filtri,ma come qualunque aggiunta o conversione non strettamente necessaria,introdotta dalla tv(difficile essere più precisi senza aver mai messo le mani su una tv che abbia questa funzione,ma chi ha presente la funzione pure direct in campo audio,sui sintoampli,credo capisca bene cosa si intende: attivandola il suono cambia,qualche conversione interna,che magari rimarrebbe sempre attiva,viene disattivata).