ecco come entrare in fasboot:
http://nvidia.custhelp.com/app/answers/detail/a_id/4359
qui puoi cancellare la cache da recovery navigando nei vari menu a video.
per cancellare la dalvik é piú complicato
si deve andare di comandi adb forzando il logon tramite utente system oppure si deve rootare e installare una recovery modificata.
se non vuoi rootare e allora devi usare i comandi adb.
se hai mai usato i comandi adb con un telefono android, funziona allo stesso modo.
ti colleghi da pc remoto, entri nella shell, e dopo esserti elevato a utente system entri nella partizione dalvik e cancelli tutto.
dopo esserti connesso alla shield con i soliti comandi adb (connect, device, etc. etc.) entri nella shell con adb shell.
una volta entrato cancelli la dalvik cosi:
shell@android:/ $ su system # passi da user "root" a "system"
system@android:/ $ cd data/dalvik-cache/
system@android:/data/dalvik-cache $ rm *
system@android:/data/dalvik-cache $ exit
shell@android:/data $ exit
se non hai mai usato una shell su linux o android evita. si possono fare danni.

limitati a cancellare la cashe da menu recovery e vedi se migliora.
PS pensavo. e se fosse solo il server plex che dopo l'aggiornamento sta aggiornando tutta la libreria rallentando il sistema? hai provato a farlo andare e vedere se poi torna tutto normale?
purtroppo su come funziona plex server su shield non posso aiutarti dato che io lo ho installato sul nas. e uso la shield solo come client.