Puoi collegare qualsiasi HDD formattato in Fat32, lo formatti con qualche utility per Windows, non da Windows sennò ti fa al massimo una partizione da 32GB, anche se ipotizziamo tu hai un HDD USB da 500GB.
Formattando con un utility ottieni quindi una partizione che occupa tutti i 500GB, e che la Ps3 ti vede per intero. In questo spazio però, dati i limiti del file system fat32 (l'unico supportato dalla ps3 sui dischi esterni), puoi metterci files al massimo di 4GB l'uno, non di piu.
Inoltre non serve metterci gli MKV perchè la ps3 non li supporta in maniera nativa, ad oggi. Quindi vai a fare il browse del disco e manco te li vede.
Per il resto puoi seminare il disco di cui abbiamo parlato di centinaia di .avi, wmv, mp4 etc, e la ps3 te li farà vedere tutti, rimangono fuori come detto gli mkv che metti sul pc e li vedi dalla rete, via ps3 media server.