da vc-1 a mkv h.264

Buonasera!è molto che cerco un buon programma per fare questo lavoro,in pratica uso un wd element play per vedere film hd e bluray...purtroppo però non mi supporta il vc-1..ora io sono abituato a fare copie 1:1 in mkv h.264,perchè col wd element si vedono perfettamente,mentre da alcuni problemi con fps a 25,ma questo è un'altro discorso...ora la domanda è se esiste un programma o comunque un modo per convertire il film da vc-1 in mkv h.264 lasciando l'ac3 come audio...ho provato con avs ma a meno che non sono imbranato io(probabile^^)non mi fa lasciare l'ac3,devo scegliere tra mp3 e mpeg,mentre per un bluray 1:1 vorrei almeno l'ac3...grazie!!