Conversione STREAM VC-1 a H.264

Spett.li utenti del forum,

mi rivolgo a voi convinto di trovare una rapida soluzione ai miei "problemi".

Da circa un anno posseggo un WDTV LIVE SMP (GEN 3) col quale, tramite HDD NTFS esterni, ho potuto riprodurre qualsiasi formato video (480p, 720p, 1080i/p) senza alcun problema di codecs.
Recentemente, però, mi sono reso conto che gli MKV con stream video codificato in VC-1 danno evidenti problemi di stuttering che, ovviamente, sono davvero fastidiosi: a meno che la Western Digital non risolva il problema con aggiornamenti firmwares (attualmente fermi alla v2.02.32 dell'AGOSTO 2014), mi vedo costretto ad effettuare un transcoding del flusso video VC-1 verso uno sicuramente compatibile come l'H.264.

Ma è proprio qui che sorge il mio problema: tra Handbrake, meGui, ripBot264, xMediaRecode, FormatFactory e chi più ne ha più ne metta, non sono ancora riuscito a trovare un programma che converta con semplicità il VC-1 contenuto nell'MKV...qualcuno di voi ha suggerimenti ?

Non si tratta di una conversione ma di una vera ricodifica.
Se vuoi la semplicità al massimo livello ti consiglierei XVID4PSP versione 6.
Ci sono già profili preimpostati che ti permettono di impostare il file di uscita come vuoi sia in termini di bit rate con la possibilità di copiare l' audio senza sottoporlo ad ulteriori passaggi di codifica.
Se te la cavi con l' inglese ti consiglierei di consultare videohelp.com