Mkv con video h.264 interlacciato

Ho questo dubbio e difficoltà . sto cercando di codificare in mkv un dvd pal 25 fps interlacciato con Handbrake.
tutto a posto a parte il fatto che l'mkv mi risulta essere progressivo almeno dall'header mentre il video è ancora interlacciato. vorrei evitare di deinterlacciarlo e fare in modo che ci pensi la gpu via uvd / Hw (ho una ati 5770).
solo che non lo fa. non ho capito se funziona solo via codec mpeg-2 o anche in avc. ovviamente ho la certezza di essere in dvxa2 perchè sia coreavc sia mpc-hc decoder lo evidenziano.
idee? :)